闽南师范大学档案馆于2010年6月设立，于2019年学校机构改革后归入学校办公室。现形成校长负责，分管校领导分管，各部门主要负责同志具体负责的管理机制，各部门设档案员，部门档案员负责本部门日常工作中形成文件材料的收集、整理、移交归档工作，档案馆具体指导各部门、系、室相关档案业务。

    我馆现有专职档案工作人员2人，部门档案员42人，其中专职档案工作人员均为副高级档案职称人员。档案用房500平方米，其中档案库房面积360平方米。馆藏档案有 2个全宗，馆藏档案数量34002卷、文件资料26000多件。管理全校党群、行政、教学、科研、基建、设备、出版物、外事、财会、声像、实物等各种门类和载体的档案。

    学校档案馆的前身是1989年成立的综合档案室。原综合档案室于1990年获得福建省直机关甲级档案室称号，于1997年获得福建省一级档案管理单位。2006年2月学院综合档案室平闽同志被福建省档案局授予2002--2004年度福建省档案工作优秀工作者荣誉称号。闽南师范大学被福建省高等教育学会档案专业委员会评为2014-2021年连续8年福建省高校档案宣传信息工作先进单位。2021年11月档案馆林建洪同志被福建省档案局评选为第二届福建省“档案专家”称号。

    近年来，档案馆在档案编研及校史研究工作方面取得了一定的成绩，一共组织编写完成了《闽南师范大学大事记（1958—2018）》《闽南师范大学图文大事记（2018.11—2020.10）》《闽南师范大学大事记（2020.11—2023.10）》等三本大事记的编撰出版任务；为校史研究工作提供口述历史采集、历史实物征集、旧照片征集等工作，研究并撰写了学校第一部校史研究成果《福建第二师范学院校史研究（第一辑）》，推动学校在原福建第二师范学院校史工作上实现破冰。

    下一阶段，档案馆将紧密围绕学校工作大局和未来发展规划，不断完善工作机制，坚持改革创新，不断提升“服务大局、服务发展、服务群众”的“三服务”水平，努力建设成为规范、高效、安全的全方位、多功能档案馆。